96孔微孔板離心機主要是利用物質之間的密度差來進行工作的，離心分離是指液-液、液－液－固的兩相或三相分離，但相與相之間必須是互不相溶的非均相體系。由于液－液兩相的含量不同，如輕相液量多、重相液量少，或輕相液量少，重相液量多，在碟式離心機中形成的液－液兩相分離分界面的位置剛好落在碟片中心孔的位置上，這樣的兩相分布，分離效果。此處，輕、重兩相分離后的取出流量與相界面的位置移動也有關系，如輕液取出量大時，相界面位置會向機器軸線中心移動，重相取出量大時，相界面位置會遠離機器軸線中心，通常管式離心機和碟式離心機運行時均需通過機器的調整環來調整兩相取出流量。選用微型離心機時，必須考慮輕、重兩相的含量和碟式中心孔的位置，以使機器運行時達到好的分離效果。